Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
URB1O60287 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
URB1O60287 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
URB1O60287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
URB1O60287 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
URB1O60287 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
URB1O60287 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
URB1O60287 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
URB1O60287 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
URB1O60287 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
URB1O60287 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
URB1O60287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
URB1O60287 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
URB1O60287 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
URB1O60287 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
URB1O60287 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
URB1O60287 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
URB1O60287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
URB1O60287 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
URB1O60287 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
URB1O60287 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
URB1O60287 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
URB1O60287 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
URB1O60287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
URB1O60287 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
URB1O60287 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
URB1O60287 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
URB1O60287 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
URB1O60287 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
URB1O60287 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
URB1O60287 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
URB1O60287 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
URB1O60287 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
URB1O60287 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
URB1O60287 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
URB1O60287 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
URB1O60287 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
URB1O60287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
URB1O60287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
URB1O60287 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
URB1O60287 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
URB1O60287 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
URB1O60287 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
URB1O60287 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
URB1O60287 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
URB1O60287 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
URB1O60287 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
URB1O60287 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
URB1O60287 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
URB1O60287 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
URB1O60287 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
URB1O60287 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
URB1O60287 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
URB1O60287 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
URB1O60287 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
URB1O60287 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
URB1O60287 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
URB1O60287 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
URB1O60287 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
URB1O60287 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
URB1O60287 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
URB1O60287 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
URB1O60287 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
URB1O60287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
URB1O60287 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
URB1O60287 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
URB1O60287 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
URB1O60287 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
URB1O60287 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
URB1O60287 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
URB1O60287 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
URB1O60287 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
URB1O60287 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
URB1O60287 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
URB1O60287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
URB1O60287 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
URB1O60287 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
URB1O60287 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
URB1O60287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
URB1O60287 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
URB1O60287 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
URB1O60287 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
URB1O60287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
URB1O60287 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
URB1O60287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
URB1O60287 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
URB1O60287 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
URB1O60287 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms