Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mmp10O55123 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mmp10O55123 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mmp10O55123 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mmp10O55123 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mmp10O55123 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mmp10O55123 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mmp10O55123 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmp10O55123 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mmp10O55123 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mmp10O55123 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mmp10O55123 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mmp10O55123 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmp10O55123 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Mmp10O55123 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mmp10O55123 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mmp10O55123 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp10O55123 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp10O55123 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp10O55123 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mmp10O55123 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mmp10O55123 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp10O55123 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp10O55123 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms