Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
StrnO55106 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
StrnO55106 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
StrnO55106 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
StrnO55106 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
StrnO55106 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
StrnO55106 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
StrnO55106 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
StrnO55106 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
StrnO55106 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
StrnO55106 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
StrnO55106 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
StrnO55106 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
StrnO55106 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
StrnO55106 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
StrnO55106 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
StrnO55106 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
StrnO55106 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
StrnO55106 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
StrnO55106 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
StrnO55106 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
StrnO55106 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
StrnO55106 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
StrnO55106 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
StrnO55106 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
StrnO55106 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
StrnO55106 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
StrnO55106 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
StrnO55106 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
StrnO55106 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
StrnO55106 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
StrnO55106 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
StrnO55106 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
StrnO55106 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
StrnO55106 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
StrnO55106 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
StrnO55106 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
StrnO55106 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
StrnO55106 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
StrnO55106 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
StrnO55106 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
StrnO55106 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
StrnO55106 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
StrnO55106 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
StrnO55106 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
StrnO55106 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
StrnO55106 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
StrnO55106 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
StrnO55106 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
StrnO55106 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
StrnO55106 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
StrnO55106 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
StrnO55106 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
StrnO55106 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
StrnO55106 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
StrnO55106 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
StrnO55106 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
StrnO55106 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
StrnO55106 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
StrnO55106 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
StrnO55106 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
StrnO55106 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
StrnO55106 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
StrnO55106 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
StrnO55106 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
StrnO55106 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
StrnO55106 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
StrnO55106 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
StrnO55106 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
StrnO55106 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
StrnO55106 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
StrnO55106 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
StrnO55106 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
StrnO55106 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
StrnO55106 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
StrnO55106 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
StrnO55106 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
StrnO55106 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
StrnO55106 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
StrnO55106 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
StrnO55106 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
StrnO55106 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
StrnO55106 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
StrnO55106 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
StrnO55106 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
StrnO55106 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
StrnO55106 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
StrnO55106 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
StrnO55106 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
StrnO55106 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
StrnO55106 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
StrnO55106 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
StrnO55106 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
StrnO55106 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
StrnO55106 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
StrnO55106 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
StrnO55106 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
StrnO55106 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
StrnO55106 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
StrnO55106 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms