Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Gjd2O54851 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gjd2O54851 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gjd2O54851 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gjd2O54851 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gjd2O54851 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gjd2O54851 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Gjd2O54851 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gjd2O54851 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gjd2O54851 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gjd2O54851 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gjd2O54851 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gjd2O54851 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gjd2O54851 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gjd2O54851 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Gjd2O54851 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gjd2O54851 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,6 ms