Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna4O08542 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna4O08542 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna4O08542 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna4O08542 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna4O08542 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna4O08542 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna4O08542 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efna4O08542 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna4O08542 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efna4O08542 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efna4O08542 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efna4O08542 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efna4O08542 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Efna4O08542 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efna4O08542 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efna4O08542 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efna4O08542 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efna4O08542 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efna4O08542 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms