Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF225M0QZC1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF225M0QZC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF225M0QZC1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF225M0QZC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF225M0QZC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF225M0QZC1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF225M0QZC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms