Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
5830473C10RikF8VQ07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
5830473C10RikF8VQ07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
5830473C10RikF8VQ07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
5830473C10RikF8VQ07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
5830473C10RikF8VQ07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
5830473C10RikF8VQ07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms