Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApobE9Q414 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApobE9Q414 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApobE9Q414 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApobE9Q414 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApobE9Q414 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms