Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa28D3Z1V9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa28D3Z1V9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa28D3Z1V9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa28D3Z1V9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa28D3Z1V9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms