Protein–RNA interactions for Protein: B9A014

C21orf140, Uncharacterized protein C21orf140, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf140B9A014 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C21orf140B9A014 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf140B9A014 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf140B9A014 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C21orf140B9A014 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C21orf140B9A014 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C21orf140B9A014 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C21orf140B9A014 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C21orf140B9A014 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C21orf140B9A014 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C21orf140B9A014 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms