Protein–RNA interactions for Protein: B7Z3J9

LOC730098, HCG2040265, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC730098B7Z3J9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LOC730098B7Z3J9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LOC730098B7Z3J9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LOC730098B7Z3J9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOC730098B7Z3J9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOC730098B7Z3J9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LOC730098B7Z3J9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOC730098B7Z3J9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms