Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ERVV-1B6SEH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERVV-1B6SEH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERVV-1B6SEH8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERVV-1B6SEH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERVV-1B6SEH8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ERVV-1B6SEH8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERVV-1B6SEH8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERVV-1B6SEH8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERVV-1B6SEH8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
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