Protein–RNA interactions for Protein: B1ARW8

Uncharacterized protein C1orf122 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B1ARW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B1ARW8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B1ARW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B1ARW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B1ARW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B1ARW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B1ARW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B1ARW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B1ARW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B1ARW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B1ARW8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B1ARW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B1ARW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B1ARW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B1ARW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B1ARW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B1ARW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
B1ARW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B1ARW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B1ARW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B1ARW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B1ARW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
B1ARW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B1ARW8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B1ARW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B1ARW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B1ARW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B1ARW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B1ARW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B1ARW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B1ARW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B1ARW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B1ARW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B1ARW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B1ARW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B1ARW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B1ARW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B1ARW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B1ARW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B1ARW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B1ARW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B1ARW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B1ARW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B1ARW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B1ARW8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B1ARW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B1ARW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B1ARW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B1ARW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B1ARW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B1ARW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B1ARW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B1ARW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
B1ARW8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B1ARW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
B1ARW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B1ARW8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B1ARW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B1ARW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B1ARW8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B1ARW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B1ARW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B1ARW8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B1ARW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B1ARW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B1ARW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B1ARW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B1ARW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B1ARW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B1ARW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B1ARW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B1ARW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B1ARW8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B1ARW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B1ARW8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B1ARW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B1ARW8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B1ARW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B1ARW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B1ARW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B1ARW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B1ARW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
B1ARW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B1ARW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B1ARW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B1ARW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B1ARW8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B1ARW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B1ARW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B1ARW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B1ARW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B1ARW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B1ARW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B1ARW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B1ARW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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