Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD3A6NKT7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD3A6NKT7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RGPD3A6NKT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD3A6NKT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD3A6NKT7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RGPD3A6NKT7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD3A6NKT7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
RGPD3A6NKT7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RGPD3A6NKT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms