Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPA6NDG6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPA6NDG6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPA6NDG6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPA6NDG6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPA6NDG6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGPA6NDG6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGPA6NDG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPA6NDG6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms