Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIFINA4D1Z8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIFINA4D1Z8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIFINA4D1Z8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIFINA4D1Z8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIFINA4D1Z8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIFINA4D1Z8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GRIFINA4D1Z8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIFINA4D1Z8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms