Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13941A2AJ38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13941A2AJ38 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm13941A2AJ38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm13941A2AJ38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm13941A2AJ38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm13941A2AJ38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm13941A2AJ38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm13941A2AJ38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm13941A2AJ38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm13941A2AJ38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm13941A2AJ38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm13941A2AJ38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm13941A2AJ38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm13941A2AJ38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm13941A2AJ38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms