Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Prdm16A2A935 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Prdm16A2A935 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Prdm16A2A935 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Prdm16A2A935 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Prdm16A2A935 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Prdm16A2A935 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Prdm16A2A935 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Prdm16A2A935 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Prdm16A2A935 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Prdm16A2A935 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Prdm16A2A935 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Prdm16A2A935 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Prdm16A2A935 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Prdm16A2A935 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Prdm16A2A935 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Prdm16A2A935 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Prdm16A2A935 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Prdm16A2A935 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Prdm16A2A935 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Prdm16A2A935 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Prdm16A2A935 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Prdm16A2A935 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Prdm16A2A935 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Prdm16A2A935 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm16A2A935 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm16A2A935 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm16A2A935 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms