Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6X5

TRAV18, T-cell receptor alpha variable 18 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV18A0A075B6X5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV18A0A075B6X5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV18A0A075B6X5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAV18A0A075B6X5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAV18A0A075B6X5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV18A0A075B6X5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAV18A0A075B6X5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV18A0A075B6X5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms