Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
S4R3F8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
S4R3F8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
S4R3F8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
S4R3F8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms