Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CD2APQ9Y5K6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CD2APQ9Y5K6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms