Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDP1Q9Y5B0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms