Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KNSTRNQ9Y448 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms