Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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