Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9Y3F1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms