Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REXO2Q9Y3B8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REXO2Q9Y3B8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REXO2Q9Y3B8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
REXO2Q9Y3B8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms