Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms