Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms