Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC5Q9UQL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC5Q9UQL6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms