Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms