Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms