Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms