Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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