Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIZ1Q9ULV3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIZ1Q9ULV3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms