Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED23Q9ULK4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms