Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms