Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHIC2Q9UKJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms