Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PILRAQ9UKJ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PILRAQ9UKJ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms