Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms