Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms