Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA4Q9UI42 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms