Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms