Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms