Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms