Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms