Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC4Q9UBN4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms