Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3BQ9UBC3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms