Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms