Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP35Q9P2H5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
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