Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHPF2Q9P2E5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms